Скит имеет древнюю историю, уходящую в VIII век, когда в пещерном городе Качи-Кальон обосновались византийские монахи. Монастырь был уничтожен в 1778 году при переселении христиан из Крыма. Его современное возрождение началось только в 2005 году, когда сюда пришли несколько монахов. Старая штольня в скале была переоборудована в церковь. Из-за высокой влажности в пещере обычные краски и фрески быстро осыпались, и настоятель принял гениальное решение — украшать убранство бисером, камнями и бусинами, которым не страшна сырость.
Сегодня Бисерный храм — это уникальное произведение искусства и одно из главных мест для паломничества в Крыму. Стены, потолок, иконостас и даже лампады пещерной церкви кропотливо выложены миллионами разноцветных бусин, стеклярусом и ювелирными камнями. В свете свечей все это мерцает и переливается, создавая невероятную, почти сказочную атмосферу. Это самый впечатляющий и необычный храм Крыма, который сильно выделяется на фоне других пещерных монастырей Бахчисарая.



